Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nipsnap2O55126 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nipsnap2O55126 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms