Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nipsnap1O55125 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap1O55125 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms