Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr1O55100 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr1O55100 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms