Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pole2O54956 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pole2O54956 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms