Protein–RNA interactions for Protein: O54951

Sema6b, Semaphorin-6B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6bO54951 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sema6bO54951 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sema6bO54951 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms