Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NlkO54949 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NlkO54949 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
NlkO54949 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
NlkO54949 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NlkO54949 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms