Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TsksO54887 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TsksO54887 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TsksO54887 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TsksO54887 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TsksO54887 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TsksO54887 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsksO54887 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsksO54887 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsksO54887 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsksO54887 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsksO54887 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsksO54887 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TsksO54887 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TsksO54887 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TsksO54887 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TsksO54887 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TsksO54887 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms