Protein–RNA interactions for Protein: O54836

Zmat3, Zinc finger matrin-type protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zmat3O54836 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Zmat3O54836 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Zmat3O54836 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zmat3O54836 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms