Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Csnk2a2O54833 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Csnk2a2O54833 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms