Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbrO54799 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NmbrO54799 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NmbrO54799 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms