Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
DffbO54788 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
DffbO54788 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
DffbO54788 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
DffbO54788 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
DffbO54788 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
DffbO54788 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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