Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CrxO54751 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrxO54751 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrxO54751 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrxO54751 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrxO54751 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrxO54751 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrxO54751 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CrxO54751 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CrxO54751 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CrxO54751 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CrxO54751 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CrxO54751 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CrxO54751 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms