Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnc1O35914 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bnc1O35914 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms