Protein–RNA interactions for Protein: O35904

Pik3cd, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit delta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3cdO35904 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pik3cdO35904 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Pik3cdO35904 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms