Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ppfibp2O35711 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ppfibp2O35711 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms