Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NudcO35685 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NudcO35685 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NudcO35685 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NudcO35685 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
NudcO35685 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NudcO35685 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NudcO35685 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NudcO35685 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NudcO35685 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NudcO35685 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NudcO35685 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms