Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Notch2O35516 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Notch2O35516 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Notch2O35516 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms