Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sema6aO35464 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sema6aO35464 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms