Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TnxbO35452 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
TnxbO35452 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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TnxbO35452 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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TnxbO35452 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TnxbO35452 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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TnxbO35452 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TnxbO35452 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TnxbO35452 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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TnxbO35452 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TnxbO35452 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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TnxbO35452 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms