Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Xbp1O35426 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Xbp1O35426 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms