Protein–RNA interactions for Protein: O35385

Ppef2, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 2, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppef2O35385 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ppef2O35385 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ppef2O35385 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms