Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Abcc1O35379 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Abcc1O35379 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Abcc1O35379 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms