Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Kpna3O35344 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Kpna3O35344 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms