Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Kpna4O35343 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Kpna4O35343 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms