Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CenpaO35216 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CenpaO35216 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CenpaO35216 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CenpaO35216 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpaO35216 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpaO35216 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CenpaO35216 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms