Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Nedd9O35177 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Nedd9O35177 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms