Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Scarb2O35114 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Scarb2O35114 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms