Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Q1O19441 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Q1O19441 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms