Protein–RNA interactions for Protein: O08810

Eftud2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 971 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2O08810 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Eftud2O08810 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Eftud2O08810 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms