Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Dctn1O08788 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Dctn1O08788 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms