Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 894 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MttpO08601 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MttpO08601 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MttpO08601 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MttpO08601 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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MttpO08601 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MttpO08601 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MttpO08601 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MttpO08601 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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MttpO08601 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MttpO08601 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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MttpO08601 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MttpO08601 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MttpO08601 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MttpO08601 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MttpO08601 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MttpO08601 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MttpO08601 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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