Protein–RNA interactions for Protein: L7N1Z3

Vmn1r80, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r80L7N1Z3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r80L7N1Z3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vmn1r80L7N1Z3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.2 ms