Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm5225J3QPL3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm5225J3QPL3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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