Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Gm5294J3QP53 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Gm5294J3QP53 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms