Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
Ccdc180J3QNE4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
Ccdc180J3QNE4 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Ccdc180J3QNE4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms