Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3415J3QMS8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gm3415J3QMS8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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Gm3415J3QMS8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3415J3QMS8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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