Protein–RNA interactions for Protein: J3QMA4

Zfp870, Zinc finger protein 870, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp870J3QMA4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Zfp870J3QMA4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Zfp870J3QMA4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp870J3QMA4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp870J3QMA4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp870J3QMA4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Zfp870J3QMA4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms