Protein–RNA interactions for Protein: J3KML6

Gm20830, Predicted gene, 20830, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20830J3KML6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gm20830J3KML6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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