Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
AK157302I3ITR1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
AK157302I3ITR1 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms