Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cldn20G5E8X0 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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