Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pcf11G3X9Z4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pcf11G3X9Z4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 221.8 ms