Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hmgxb3G3X9M3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hmgxb3G3X9M3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms