Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arfgef1G3X9K3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Arfgef1G3X9K3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms