Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3tc1G3X9F6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3tc1G3X9F6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms