Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Speer4cG3UXD1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Speer4cG3UXD1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms