Protein–RNA interactions for Protein: G3UWE6

Vmn1r39, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r39G3UWE6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r39G3UWE6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r39G3UWE6 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms