Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Susd5G3UW60 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Susd5G3UW60 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms