Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ercc6F8VPZ5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
Ercc6F8VPZ5 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ercc6F8VPZ5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms