Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm28038F7BCN9 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm28038F7BCN9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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