Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rarres1F6ZIS7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rarres1F6ZIS7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.5 ms